Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdhr2E9Q7P9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdhr2E9Q7P9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdhr2E9Q7P9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdhr2E9Q7P9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms