Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Urb2E9Q7L1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Urb2E9Q7L1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Urb2E9Q7L1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms