Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp31E9Q6Y8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp31E9Q6Y8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms