Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc121E9Q6D3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc121E9Q6D3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc121E9Q6D3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc121E9Q6D3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc121E9Q6D3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms