Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtproE9Q612 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtproE9Q612 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtproE9Q612 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms