Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdhb9E9Q5G2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms