Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
BC005561E9Q5E2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BC005561E9Q5E2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BC005561E9Q5E2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BC005561E9Q5E2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.39■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BC005561E9Q5E2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms