Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms