Protein–RNA interactions for Protein: E9Q101

Gm6034, Predicted gene 6034, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6034E9Q101 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6034E9Q101 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6034E9Q101 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms