Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B3

Uncharacterized membrane protein C3orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9Q0B3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E9Q0B3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E9Q0B3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E9Q0B3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E9Q0B3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9Q0B3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9Q0B3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9Q0B3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9Q0B3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9Q0B3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms