Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ryr1E9PZQ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ryr1E9PZQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ryr1E9PZQ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ryr1E9PZQ0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ryr1E9PZQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Ryr1E9PZQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ryr1E9PZQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ryr1E9PZQ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms