Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chd2E9PZM4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chd2E9PZM4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Chd2E9PZM4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chd2E9PZM4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms