Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gcom1E9PZ54 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms