Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ift140E9PY46 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ift140E9PY46 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ift140E9PY46 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ift140E9PY46 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ift140E9PY46 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms