Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sfta2E9PXB6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfta2E9PXB6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms