Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc144bE9PVZ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc144bE9PVZ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms