Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ttc17E9PVB5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc17E9PVB5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms