Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca3bE9PUL3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms