Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms