Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc78D3Z5T1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc78D3Z5T1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms