Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm10110D3Z5M2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm10110D3Z5M2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms