Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms