Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd1D3YXK1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd1D3YXK1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms