Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BC048679D3YXE9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms