Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rexo5D3YW29 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo5D3YW29 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms