Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap70D3YVL2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap70D3YVL2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap70D3YVL2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms