Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cttnbp2B9EJA2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cttnbp2B9EJA2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Cttnbp2B9EJA2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cttnbp2B9EJA2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cttnbp2B9EJA2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cttnbp2B9EJA2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cttnbp2B9EJA2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Cttnbp2B9EJA2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms