Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Gm20547B8JJN0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Gm20547B8JJN0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20547B8JJN0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Gm20547B8JJN0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Gm20547B8JJN0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Gm20547B8JJN0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Gm20547B8JJN0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Gm20547B8JJN0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20547B8JJN0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20547B8JJN0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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