Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71aB7XG49 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71aB7XG49 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms