Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia1B2RXQ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia1B2RXQ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia1B2RXQ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms