Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018F24RikB2RW27 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700018F24RikB2RW27 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms