Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms