Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AU015836B2RUM3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AU015836B2RUM3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms