Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf518bB2RRE4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Znf518bB2RRE4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Znf518bB2RRE4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms