Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NhsB1AV60 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NhsB1AV60 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NhsB1AV60 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NhsB1AV60 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms