Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spocd1B1ASB6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms