Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grik3B1AS29 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms