Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms