Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf39A2RT81 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms