Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Htra4A2RT60 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms