Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
4931406B18RikA2RSL7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms