Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samt1A2BED8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms