Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl41A2AUC9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl41A2AUC9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms