Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef17A2ASJ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms