Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubb1A2AQ07 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms