Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms