Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FocadA2AKG8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FocadA2AKG8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms