Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lcn6A2AJB9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcn6A2AJB9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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