Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc183A2AJB1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc183A2AJB1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc183A2AJB1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms