Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms